性实在是太高了。以至于诊疗指南上都推荐，对患者需要连续进行最少三次以上的采样涂片染色检测，以尽量降低假阴性的可能性——更要命的是，涂片阳性也不见得就真的是结核病，非结核分歧杆菌、麻风分歧杆菌、努卡军和放线菌也可能在染色下呈现假阳性反应。
因此，现在的“金标准”推荐使用分离培养法进行更加准确的诊断——但分离培养法的阳性率依旧不够理想，而且整段时间长的不是一般。国内常用的改良罗氏培养法需要培养四到六周，也就是一个月到一个半月，三十到四十五天左右。
大名鼎鼎的PCR技术可以用在检测中，它能够将样本中的微量结核菌DNA扩增，短时间内扩增上百倍以方便检测。但假阴性和无法区分结核分歧杆菌与非结核分歧杆菌的缺陷不但没有得到改善，甚至还有无法分别死菌活菌，无法判定临床疗效等更多的麻烦。
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